'Under overfladen - Alcatraz' bruger de nyeste avancerede grafikeffekter for at ’dræne’ havet omkring den berygtede ø Alcatraz. Når havet er drænet, kan man se hemmelighederne ved Alcatraz, og hvorfor øens berygtede fængsel er så svært at flygte fra. Når vandet er væk, ses det også, at San Francisco Bay er et fascinerende og kaotisk sted. På havbunden ses ar efter kraftige jordskælv. Disse forkastningslinjer giver videnskabsfolkene en idé om, hvornår og hvor det næste ’store jordskælv’ vil ramme. Når hele området er drænet, kan man se, hvad der kan ske med San Francisco, når det næste store jordskælv rammer, og hvad der vil være tilbage af Alcatraz, når støvet har lagt sig.