Skjult under vandet ved Kingston Harbour i Jamaica, ligger ruinerne af Port Royal, den største piratby nogensinde. Med sit ry for ekstravagance, sprut og ludere, var den kendt som den mest "ugudelige by på jorden". Den 7. juni 1692 blev byen udslettet af et jordskælv, efterfulgt af en tsunami. To tredjedele sank i havet på få minutter og 5.000 mennesker døde i katastrofen og dens eftervirkninger. Siden Port Royals genopdagelse i det 19. århundrede kunne adskillige udgravninger på stedet afsløre ruiner og piratskatte. Men nu vil arkæologen Dr. Jon Henderson, ved hjælp af de nyeste videnskabelige og højteknologiske undersøgelser, afsløre det fulde omfang af den 13 hektar store forliste by for første gang. Man vil kunne se nye billeder af Port Royal og dens dramatiske endeligt. Vi vil praktisk talt tørlægge byen og genopbygge den ved hjælp af computergenererede billeder for at løse nogle af de ældgamle mysterier. Hvordan blev hjemstedet for de oprindelige Pirates of the Caribbean til den vigtigste handelsby i Den Nye Verden? Hvor befinder byens fæstninger fra det 17. århundrede sig nu? Samt at sandet, hvorpå Port Royal blev bygget, bare var en geologisk katastrofe, der ventede på at ske.